Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECM1Q16610 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms