Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDCD2Q16342 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms