Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NTRK3Q16288 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NTRK3Q16288 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms