Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFKBIBQ15653 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms