Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SYCP1Q15431 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SYCP1Q15431 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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