Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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PTPRRQ15256 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRRQ15256 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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