Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PDK3Q15120 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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