Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GAPVD1Q14C86 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GAPVD1Q14C86 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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