Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX2Q13950 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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