Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
MTMR3Q13615 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms