Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms