Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
STX4Q12846 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
STX4Q12846 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
STX4Q12846 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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