Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNA1Q09470 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms