Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB2Q08289 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB2Q08289 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms