Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms