Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TLE4Q04727 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TLE4Q04727 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms