Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYP27A1Q02318 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CYP27A1Q02318 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms