Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPEQ02224 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms