Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNC1Q01954 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms