Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPIBQ01892 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms