Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CACNA1DQ01668 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms