Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3AP98173 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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