Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms