Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TMEM258P61165 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TMEM258P61165 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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TMEM258P61165 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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