Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2BFSP57053 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms