Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms