Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms