Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMARCA2P51531 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMARCA2P51531 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms