Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GRIA4P48058 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms