Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNPDA1P46926 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms