Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC19A1P41440 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms