Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFHR2P36980 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms