Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms