Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC13P31276 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms