Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLIP1P30622 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms