Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CASP1P29466 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CASP1P29466 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CASP1P29466 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms