Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LOXP28300 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LOXP28300 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LOXP28300 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXP28300 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXP28300 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXP28300 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXP28300 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXP28300 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LOXP28300 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms