Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTAFRP25105 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms