Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD53P19397 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD53P19397 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD53P19397 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms