Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT4P19013 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRT4P19013 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms