Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF35P13682 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms