Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C4BP0C0L5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C4BP0C0L5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms