Protein–RNA interactions for Protein: P08174

CD55, Complement decay-accelerating factor, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55P08174 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CD55P08174 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CD55P08174 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD55P08174 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD55P08174 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms