Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HTR3BO95264 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms