Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRGAP3O43295 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms