Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHF1O43189 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF1O43189 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF1O43189 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms