Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF113AO15541 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms