Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLRMTO00411 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLRMTO00411 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms