Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8-MDP1E9PL57 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms