Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP17L12C9JPN9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L12C9JPN9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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